Baltrūnas - lietuviška vyriškos giminės pavardė.
Šios pavardės moteriškosios giminės formos yra: Baltrūnienė (ištekėjusi moteris) ir Baltrūnaitė (mergautinė pavardė).
Pavardę turi šie garsesni asmenys:
- Aleksandras Baltrūnas – matematikas, istorikas;
- Aleksas Baltrūnas – rašytojas;
- Dalis Antanas Baltrūnas – fizikas;
- Gintaras Baltrūnas – chemikas;
- Laimutis Baltrūnas – politikas;
- Leonas Baltrūnas – krepšinio žaidėjas ir treneris;
- Valentinas Baltrūnas – geologas,
politikas.