Jokubaitis - lietuviška vyriškos giminės pavardė.
Šios pavardės moteriškosios giminės formos yra: Jokubaitienė (ištekėjusi moteris) ir Jokubaitytė (mergautinė pavardė).
Pavardę turi šie garsesni asmenys:
- Aivaras Jokubaitis (g. 1974) – Lietuvos krepšininkas
rungtyniaujantis „Mažeikių“ krepšinio komandoje;
- Alvydas Jokubaitis (g. 1959) – Lietuvos filosofas, politologas, humanitarinių mokslų daktaras;