Motiejūnaitė - lietuviška moteriškos giminės pavardė (mergautinė pavardė).
Šios pavardės kita moteriškosios giminės forma yra: Motiejūnienė (ištekėjusi moteris).
Ši pavardė kilusi iš vyriškos giminės pavardės Motiejūnas.
Pavardę turi šie garsesni asmenys:
- Jurga Motiejūnaitė (g. 1961) – Lietuvos botanikė, biomedicinos mokslų daktarė;
- Lidija Motiejūnaitė (1924–2008) – Lietuvos baleto artistė, pedagogė, choreografė, menotyrininkė, humanitarinių mokslų daktarė;