Paukštys - lietuviška vyriškos giminės pavardė.
Šios pavardės moteriškosios giminės formos yra: Paukštienė (ištekėjusi moteris) ir Paukštytė (mergautinė pavardė).
Pavardę turi šie garsesni asmenys:
- Alfonsas Paukštys (1913–1974) – Lietuvos smuikininkas;
- Jonas Paukštys – vienuolis, pedagogas;
- Juozas Skirmantas Paukštys – gydytojas, politikas;
- Kęstutis Povilas Paukštys – politikas;
- Saulius Paukštys – fotomenininkas;
- Vincas Paukštys – rašytojas, visuomenės veikėjas.